Kako se COVID samouništenje u Japanu?

Kako se COVID samouništenje u Japanu?
Kako se COVID samouništenje u Japanu?
Anonim

Zašto se peti i najveći talas japanske pandemije koronavirusa, potaknut super-zaraznom varijantom "Delta", iznenada završio nakon naizgled nemilosrdnog porasta novih infekcija? I po čemu se Japan razlikovao od drugih razvijenih zemalja koje sada bilježe novi porast broja slučajeva?

Prema grupi japanskih naučnika, iznenađujući odgovor može biti da se Delta varijanta pobrinula sama za sebe u činu "samonestanka".

Tri mjeseca nakon što je varijanta Delta podstakla rekordne dnevne slučajeve širom zemlje od skoro 26.000, nove infekcije COVID-19 u Japanu su naglo pale, pavši ispod 200 posljednjih sedmica. Dana 7. novembra, na primjer, nije prijavljen nijedan smrtni slučaj - prvi put u otprilike 15 mjeseci.

Mnogi naučnici ukazuju na različite mogućnosti, koje uključuju jednu od najviših stopa vakcinacije u Japanu među razvijenim zemljama od 75,7% stanovnika. Drugi potencijalni faktori su socijalno distanciranje i mjere nošenja maski koje su sada duboko usađene u japansko društvo.

Ali glavni razlog može biti vezan za genetske promjene kojima se koronavirus podvrgava tokom svoje reprodukcije, brzinom od oko dvije mutacije mjesečno. Prema potencijalno revolucionarnoj teoriji koju je predložio Ituro Inoue, profesor na Nacionalnom institutu za genetiku, varijanta Delta u Japanu akumulirala je previše mutacija nestrukturnog proteina virusa koji ispravlja greške, nazvanog nsp14. Kao rezultat toga, virus se bori da ispravi greške na vrijeme, što je na kraju dovelo do njegovog "samouništenja".

Studije pokazuju da većina ljudi u Aziji ima zaštitni enzim nazvan APOBEC3A koji napada RNA viruse, uključujući virus SARS-CoV-2 koji uzrokuje COVID-19, u poređenju s ljudima u Evropi i Africi. Stoga su naučnici sa Nacionalnog instituta za genetiku i Univerziteta Niigata odlučili da otkriju kako protein APOBEC3A utječe na protein nsp14 i može li inhibirati aktivnost koronavirusa

Tim je analizirao podatke o genetskoj raznolikosti "Alfa" i "Delta" varijanti kod zaraženih pacijenata u Japanu, od juna do oktobra.

Potom su vizualizirali odnose između sekvenci DNK virusa SARS-CoV-2 kako bi pokazali genetsku raznolikost u dijagramu koji se naziva mreža haplotipova. Općenito, što je mreža veća, ona predstavlja više pozitivnih slučajeva.

Mreža "Alpha" varijante, koja je bila glavni pokretač četvrtog talasa u Japanu od marta do juna, ima pet velikih grupa sa mnogo granastih mutacija, što potvrđuje visok nivo genetske raznolikosti. Naučnici vjeruju da će varijanta "Delta", za koju američki Centri za kontrolu i prevenciju bolesti kažu da je više nego dvostruko zaraznija od prethodnih varijanti i da može uzrokovati teže bolesti kod nevakcinisanih ljudi, imati mnogo više žive genetske raznolikosti.

Iznenađujuće je, ali japanski naučnici su otkrili činjenice koje dokazuju suprotno. Mreža haplotipova ima samo dvije glavne grupe i čini se da mutacije iznenada prestaju usred njihovog evolucijskog razvoja. Kada su naučnici nastavili proučavati virusni enzim nsp14 koji ispravlja greške, otkrili su da je velika većina uzoraka nsp14 u Japanu pretrpjela mnoge genetske promjene na mjestima mutacija, nazvanih A394V.

“Bili smo bukvalno šokirani kada smo vidjeli rezultate,” rekao je prof. Inoue za Japan Times. - Varijanta "Delta" u Japanu je bila jako zaražena i nije dozvoljavala druge varijante. Ali kako su se mutacije gomilale, mislimo da je na kraju postao defektan virus i da nije uspio napraviti kopije samog sebe. S obzirom na to da se broj slučajeva ne povećava, vjerujemo da je u nekom trenutku tokom takvih mutacija krenulo pravo ka svom prirodnom izumiranju.”

Teorija profesora Inouea, iako je inovativna, podržava misteriozni nestanak širenja Delta Variant u Japanu. Dok veći dio ostatka svijeta, sa slično visokom stopom vakcinacije, uključujući Južnu Koreju i neke zapadne zemlje, pati od rekordnih talasa novih infekcija, čini se da je Japan poseban slučaj, jer su slučajevi COVID-19 ostali umjereni unatoč vozovi i restorani koji se pune nakon završetka posljednjeg vanrednog stanja.

"Da je virus živ, slučajevi bi se sigurno povećali, jer nošenje maski i vakcinacija u nekim slučajevima ne sprečavaju iznenadne izbijanja infekcija", napomenuo je prof. Inoue.

Zaista neočekivani pad broja novih slučajeva nakon ljetnog talasa vruća je tema rasprave među mnogim stručnjacima, uključujući i one koji ne provode istraživanja o koronavirusu, kaže Takeshi Urano, profesor na Medicinskom fakultetu Univerziteta Shimane koji nije učestvovao u istraživanju koje vodi prof. Inoue.

Image
Image

“Nsp14 radi sa drugim virusnim proteinima i ima kritičnu funkciju da zaštiti virusnu RNK od degradacije,” kaže on na pitanje o prof. Inoue. - Istraživanja pokazuju da virus sa osakaćenim nsp14 ima značajno smanjenu sposobnost repliciranja, tako da to može biti jedan od faktora iza brzog pada broja novih slučajeva.”

Dobra vijest je da je Nsp14 sada uspješno ekstrahiran iz virusa, a hemijski agens za ograničavanje ovog proteina može postati obećavajući lijek, s razvojem u toku.

Japan izgleda kao anomalija jer Delta varijanta efektivno sprečava širenje Alpha i drugih covid varijanti do kraja avgusta. S druge strane, ostale zemlje – uključujući Indiju i Indoneziju, koje su bile posebno teško pogođene varijantom Delta – prijavile su kombinaciju Alpha i Delta sojeva među slučajevima.

“Sličan prirodni nestanak korona virusa mogao bi se primijetiti u inostranstvu”, rekao je prof. Japan, iako su slične mutacije na lokaciji A394V pronađene u najmanje 24 zemlje.

Teorija profesora Inouea također može pomoći u objašnjenju zašto je izbijanje teškog akutnog respiratornog sindroma (SARS) naglo završilo 2003. godine. Eksperiment in vitro u kojem su naučnici izazvali mutacije u virusu nsp14, uzrokujući SARS, dovodeći do zaključka da je na kraju se ne može razmnožavati jer se u njemu akumuliraju mutacije.

“Ne postoje podaci o genomu, tako da je to samo hipoteza, ali pošto je nestala, više nikada neće ugledati svjetlo dana”, kaže prof. Inoue.

Pa kakve su šanse da vidimo slično prirodno izumiranje virusa SARS-CoV-2 koji uzrokuje COVID-19 u inostranstvu?

“Šanse nisu nule, ali ovo se za sada čini previše optimističnim, jer takve dokaze ne možemo dobiti, iako smo gledali razne podatke i iz drugih zemalja. Nakon vrhunca sredinom avgusta, u Japanu dnevni broj slučajeva COVID-19 nastavio je da opada i padne ispod 5.000 do sredine septembra i ispod 200 do kraja oktobra.

Već neko vrijeme ova zemlja uživa jednu od najnižih stopa zaraze u bilo kojoj naprednoj zemlji, ali nije imuna na sljedeći talas pandemije, kaže prof. Inoue. - Očigledno postoji prijetnja. Bili smo dobro jer je Delta u Japanu držala druge varijante koronavirusa van zemlje. Ali sada kada ih nema čime držati podalje, napravljen je prostor za nove, a samo vakcine neće riješiti problem. U tom smislu, mislim da su mjere karantina za kontrolu imigracije veoma važne, jer nikad ne znamo šta nam može doći iz drugih zemalja."

Neki naučnici su spekulisali da je samoizumiranje varijante Delta u Japanu uzrokovano nečim posebnim u genima Japanaca, ali prof. Inoue se ne slaže.

“Ne mislim tako - odlučan je prof. Inoue. - Ljudi u istočnoj Aziji, poput Korejaca, etnički su isti kao Japanci. Ali ne znam zašto je ovo zapažanje napravljeno samo u Japanu.”

Prof. Inoue takođe kaže da tim istraživača sa Nacionalnog instituta za genetiku i Univerziteta Niigata planira da uradi temeljnu studiju svojih nalaza do kraja novembra.

Preporučuje se: